复旦大学附属中山医院胸外科主要诊治气管及肺良恶性肿瘤(如肺癌)、食管良恶性肿瘤(如食管癌、贲门癌、食管平滑肌瘤)及其他食管疾病(如贲门失驰缓症)、纵隔肿瘤(如胸腺瘤),各类胸部外伤、胸壁及胸膜疾病(如自发性气胸、乳糜胸),支气管扩张、肺气肿、脓胸、肺结核的外科治疗,肺大泡、肺脓疡、肺囊肿,胸腺瘤伴重症肌无力、膈肌疾病、心包疾病等。
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